福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目
竞价公告

http://ccgp.gov.cn/cggg/dfgg/qtgg/202012/t20201224_15692087.htm

福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目其他(网上竞价)2020年12月24日 15:17 来源:中国政府采购网 【打印】 【显示公告概要】  福建盛鑫招标代理有限公司受福建农林大学 委托,根据《中华人民共和国政府采购法》等有关规定,现对福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目进行其他招标,欢迎合格的供应商前来投标。


项目名称:福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目

项目编号:FJSXWS2020056

项目联系方式:

项目联系人:小潘

项目联系电话:0591-87600110


采购单位联系方式:

采购单位:福建农林大学

采购单位地址:福建农林大学

采购单位联系方式:何老师13509357247



代理机构联系方式:

代理机构:福建盛鑫招标代理有限公司

代理机构联系人:小潘0591-87600110

代理机构地址: 福建盛鑫招标代理有限公司



一、采购项目内容


某裸子植物denovo后续组学及生信分析



二、开标时间:2020年12月30日 11:00


三、其它补充事宜


第一部分 邀请函

一、网上竞价邀请函

受福建农林大学委托,福建盛鑫招标代理有限公司采用网上竞价采购方式组织实施本次服务的采购,现邀请合格的供应商参加网上竞价。

1. 竞价编号:FJSXWS2020056

2. 项目名称:福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目

3. 报名起止时间:2020年12月25日9:00-2020年12月29日17:00

5.竞价文件上传时间:2020年12月30日11:00之前,竞价截止时间:2020年12月30日11:00。

6.网上竞价招标文件获取:通过福建盛鑫招代理有限公司(http://www.fjsxzb.com)网站注册获得下载权限(供应商注册完成后需电话0591-87600110告知福建盛鑫招代理有限公司审核通过后才能登录下载),售价为0元。

7.以上如有变更,福建盛鑫招标代理有限公司会通过中国政府采购网

(http://www.ccgp.gov.cn/)和福建盛鑫招标代理有限公司网站(http://www.fjsxzb.com)通知,请各潜在供应商关注。


招标代理机构:福建盛鑫招标代理有限公司

地 址:福州市鼓楼区鼓东街道湖东路79号外运大厦七层

邮 编:350003

电 话:0591-87600110

联系人:小潘

电子信箱:fjsxzb@163.com


保证金账户:

开户名:福建盛鑫招标代理有限公司

开户行:中信银行福州分行

账 号:7341 0101 826 0022 7015




二、竞价服务一览表

单位:元合同包品目号名称服务内容及要求数量竞价最高限价单(元)竞价最高限价总价(元)1某裸子植物denovo后续组学及生信分析一、项目概况(采购标的)

本项目为福建农林大学某裸子植物基因组denovo后续组学及生信分析。

二、技术和服务要求

2.1 Hic测序

根据裸子植物基因组大小(10G),需开展Hic测序100Xs深度,构建7个Hic文库,并通过illumina PE150测序,得到1000G以上数据;

2.2 RNA测序

开展30个组织RNA建库测序,进行核酸提取,构建RNA测序文库,每个样本测序6G数据量。用于后续组学分析以及基因组辅助注释;

2.3 裸子植物基因组组装(10G基因组)

根据已有100X二代测序数据以及100X三代数据,开展基因组组装以及染色体挂载工作;包括测序数据质控、contig组装、Scaffold组装、gap填充、GC-depth分布分析、GC含量分析、测序深度分析、基因区覆盖度评估、基因组SNP统计,RNA序列评估、CEGMA评估、BUSCO评估、Hic染色体挂载等;

2.4 裸子植物基因组注释

2.4.1重复序列注释:利用同源序列比对的方式,基于RepBase库使用Repeatmasker和repeatproteinmask 进行重复序列注释;利用从头预测的方法对重复序列进行注释,并且对反转录转座子进行具体分类

2.4.2基因结构注释:使用Augustus,GlimmerHMM和SNAP等软件对基因结构进行预测

2.4.3基因功能注释:Swissprot注释、TrEMBL注释、KEGG注释、InterPro注释、GO注释

2.4.4非编码RNA注释:包括rRNA、tRNA、miRNA、snRNA。

2.5 裸子植物比较基因组分析

2.5.1基因家族聚类分析

2.5.2系统进化分析

2.5.3物种分歧时间估算

2.5.4基因家族扩增和收缩分析

2.5.5正选择分析

2.5.6全基因组复制分析

2.5.7基因共线性分析1246500246500合计:人民币(大写)贰拾肆万陆仟伍佰元整(¥246500.00)备注:

1、网上竞价合同须在成交通知书发出之日起15天内签订。

2、交付地点:福建农林大学

3、交付周期:90天。

4、交付条件:验收合格

5、是否收取履约保证金:否。

6、验收方式:按照标书和合同要求,供应商完成测序技术服务工作,并提供结题报告。

7、支付方式:

第1期:合同签订后,采购方支付60%合同金额的项目首款,启动项目;

第2期:待全部测序分析服务供应完毕且最终验收合格后,采购方支付40%的尾款。第二部分 竞价须知

一、合格的竞价供应商

1、凡有能力提供本招标文件所述服务,具备相关法律法规、行政规章条例和本招标文件中规定的参加采购活动应当具备的条件的境内法人均可能成为合格的投标人。

2、竞价供应商必须符合《中华人民共和国政府采购法》第22条之规定条件。

二、报名须知

1、报价人对每个项目合同包报名时都必须扫描上传合格有效的法人营业执照(三证合一)、报价代表人的法定代表人授权书(以上文件均需加盖公章)。

2、在网上竞价公告截止时间前电子报价文件应按福建盛鑫招标代理有限公司后台要求的竞价文件的报价格式填写完整,并按网上报价要求上传相关材料,未按此要求的,将被视为无效报价文件。电子报价文档具法律效力。

在网上竞价公告截止时间前电子报价文件内容可多次补充、修改,以最后一次生成为准。

3、报价人报价的货物必须符合网上竞价公告的要求,并严格按照网上竞价要求在报价文件的“报价一览表”中对服务要求作出明确、具体的确定性说明,带有范围值的参数必须写明实际投标数值,不接受可选性报价(如详细配置有“可选购、大于、小于、优于”等描述都将视为无效报价),若照抄竞价文件技术要求,出现可选性报价,或经相关比对发现其描述与实际有不符或出入的,一经查实,将视为弄虚作假,其竞价无效。

4、报价文件应包括以下内容

报价书、竞价承诺书、报价一览表、服务说明一览表、报价人声明(附资格证明文件:企业营业执照(三证合一)、法人授权委托书、网上报价承诺书)、报价人提交的其它资料(一次性上传一个文档))。

5、成交人的纸质报价文件应按后台要求的报价格式填写制作完整,并加盖报价单位公章和法定代表人(或授权代表)签字,整本报价文件须加盖骑缝章,在领取成交通知书时书面递交。

三、竞价准则

1、福建盛鑫招标代理有限公司将采购单位提出的采购需求在中国政府采购网

(http://www.ccgp.gov.cn/)和福建盛鑫招标代理有限公司网站(http://www.fjsxzb.com)上公告三个工作日。网上竞价的报价时限为竞价截止时间前,在报价时限截止前,符合采购需求的潜在供应商通过福建盛鑫招标代理有限公司网站进行竞价,供应商提交的报价必须低于公告最高限价的3%(不含)以上,否则,视为无效报价。

2、竞价结果在提交的报价文件全部满足竞价文件要求的前提下依据统一的价格要素评定最低报价, 按价格最低者成交(报价相同者以时间先后顺序确定)确认。

3、网上竞价公告期满,若无两个(含)以上供应商参与报价,或参与竞价的供应商报价不符合上述规定的,网上竞价无效。

4、报价人应遵守《政府采购法》及有关政府采购相关法规,若报价人违反规定,将按有关规定处理。

四、竞价结果确认

网上竞价公告期满,福建盛鑫招标代理有限公司应以成交结果通知书等方式书面通知采

购单位。同时将中标、成交结果信息在中国政府采购网和福建盛鑫招标代理有限公司网站上公告,采购结果公告时间为一个工作日。

五、竞价保证金

1、竞价人须提交网上竞价保证金叁仟元,各竞价人应于报价截止时间前将保证金汇达福建盛鑫招标代理有限公司指定账户。

⑴保证金为竞价响应文件的组成部分之一;

⑵保证金用于保护本次竞价免受竞价人的行为而引起的风险;

⑶保证金应以银行转账或电汇的形式提交,不接受现金形式提交;

⑷未按规定提交竞价保证金的报价,其报价将被视为无效;

⑸未成交的竞价人的保证金,在竞价结束后五个工作日内予以无息退还;

⑹成交竞价人的竞价保证金,在交货验收后,向福建盛鑫招标代理有限公司提供政府采购合同及采购人验收凭证,以原提交方式予以无息退还;

⑺竞价人在报价截止时间后,要求撤回或不按规定日期签订服务合同的,其保证金将不予退还。

2、无论报价过程中的做法和结果如何,竞价人自行承担所有参与报价的全部有关费用。

3、上述技术规格及要求中所发生的一切费用均包含在报价价格中。

六、招标代理服务费

按国家计委关于印发《招标代理服务收费管理暂行办法》的通知(计价格[2002]1980号)规定标准及与采购人签定的委托协议,向成交供应商收取招标代理服务费。

七、其它要求

1、竞价人应根据网上竞价招标文件的技术服务要求条款,在竞价响应文件中详细说明所提供服务的技术规格和参数、作业时间等。

2、竞价包含服务开始直至经采购方验收合格并交付使用所有可能发生的费用,包括清洗费、人工费、税收等费用。

3、服务地点、作业时间以竞价一览表中的为准,竞价一览表中未体现的,则在中标通知送达后,按用户指定时间为准。

4、参与竞价的供应商必须保证所提供的全部资料的真实性及准确性,竞价方若提供虚假资料获得中标(成交),将取消成交资格,没收所有保证金,并按照相关法律予以处理。

八、网上竞价结果无效的处理

为保证竞价采购竞争更加充分,防止垄断价格及货源(服务)、排斥竞争的行为,在网上竞价采购过程中,供应商、采购单位有下列情形之一的,经查实,竞价结果无效,责令采购单位限期改正,并对采购单位予以警告;对供应商列入不良行为记录名单,并在一年内禁止参加网上竞价采购活动:

(1)参与竞价的投标供应商采取串标、围标等手段谋取中标的;

(2)参与竞价的供应商与采购单位串通,采取不正当手段排挤其他供应商的;

(3)参与竞价的供应商采用厂商报备等做法,垄断价格、货源的;

(4)参与竞价的供应商提供虚假材料谋取中标、成交的。

采购单位要加强对竞价采购工作的管理,特别是在采购需求制定、合同签订、验收付款等环节,杜绝提出倾向性采购需求、指定特定供应商、无正当理由拒签采购合同、设定高技术配置需求而降低实物验收标准及不按竞价文件设定的条款擅自提高验收标准等行为。

供应商参与网上竞价项目应当遵循诚实信用原则,所投设备均应当为市场的主流设备,供应商中标后无正当理由不与采购单位签订采购合同或拒绝履行合同义务的,福建盛鑫招标代理有限公司将不予退还其缴纳的竞价保证金;情节严重的,将报由监管部门进行处理。


福建盛鑫招标代理有限公司

2020年12月24日



四、预算金额:

预算金额:24.6500000 万元(人民币)

报价情况一览表
http://ccgp.gov.cn/cggg/dfgg/cjgg/202101/t20210104_15745137.htm
结果公告

福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目成交公告2021年01月04日 09:35 来源:中国政府采购网 【打印】 【显示公告概要】一、项目编号:FJSXWS2020056(招标文件编号:FJSXWS2020056)

二、项目名称:福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目

三、中标(成交)信息

供应商名称:北京诺禾致源科技股份有限公司

供应商地址:北京诺禾致源科技股份有限公司

中标(成交)金额:20.3000000(万元)

四、主要标的信息序号供应商名称服务名称服务范围服务要求服务时间服务标准1北京诺禾致源科技股份有限公司某裸子植物denovo后续组学及生信分析某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目90天某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目五、评审专家(单一来源采购人员)名单:

福建盛鑫招标代理有限公司

六、代理服务收费标准及金额:

本项目代理费收费标准:按原国家计委关于印发《招标代理服务收费管理暂行办法》的通知(计价格[2002]1980号)规定标准及与采购人签定的委托协议,向成交供应商收取招标代理服务费。

本项目代理费总金额:0.3045000 万元(人民币)

七、公告期限

自本公告发布之日起1个工作日。

八、其它补充事宜


1、竞价编号:FJSXWS2020056

2、项目名称:福建农林大学某裸子植物denovo后续组学及生信分析项目

3、竞价公告发布时间:2020年12月25日

4、采购单位:福建农林大学

5、招标代理机构名称:福建盛鑫招标代理有限公司

地点:福州市鼓楼区鼓东街道湖东路79号外运大厦七层

电话:0591-87600110

6、采购人确认日期:2021年1月4日

7、竞价情况:详见下表

单位:元合

包品

号名称服务内容及要求数量竞价单价竞价

总价完成时间11某裸子植物denovo后续组学及生信分析一、项目概况(采购标的)

本项目为福建农林大学某裸子植物基因组denovo后续组学及生信分析。

二、技术和服务要求

2.1 Hic测序

根据裸子植物基因组大小(10G),需开展Hic测序100Xs深度,构建7个Hic文库,并通过illumina PE150测序,得到1000G以上数据;

2.2 RNA测序

开展30个组织RNA建库测序,进行核酸提取,构建RNA测序文库,每个样本测序6G数据量。用于后续组学分析以及基因组辅助注释;

2.3 裸子植物基因组组装(10G基因组)

根据已有100X二代测序数据以及100X三代数据,开展基因组组装以及染色体挂载工作;包括测序数据质控、contig组装、Scaffold组装、gap填充、GC-depth分布分析、GC含量分析、测序深度分析、基因区覆盖度评估、基因组SNP统计,RNA序列评估、CEGMA评估、BUSCO评估、Hic染色体挂载等;

2.4 裸子植物基因组注释

2.4.1重复序列注释:利用同源序列比对的方式,基于RepBase库使用Repeatmasker和repeatproteinmask 进行重复序列注释;利用从头预测的方法对重复序列进行注释,并且对反转录转座子进行具体分类

2.4.2基因结构注释:使用Augustus,GlimmerHMM和SNAP等软件对基因结构进行预测

2.4.3基因功能注释:Swissprot注释、TrEMBL注释、KEGG注释、InterPro注释、GO注释

2.4.4非编码RNA注释:包括rRNA、tRNA、miRNA、snRNA。

2.5 裸子植物比较基因组分析

2.5.1基因家族聚类分析

2.5.2系统进化分析

2.5.3物种分歧时间估算

2.5.4基因家族扩增和收缩分析

2.5.5正选择分析

2.5.6全基因组复制分析

2.5.7基因共线性分析

三、商务条件:

1、交付地点:福建农林大学

2、交付周期:90天

3、交付条件:验收合格

4、是否收取履约保证金:否。

5、验收方式:按照标书和合同要求,供应商完成测序技术服务工作,并提供结题报告。

7、支付方式:

第1期:合同签订后,采购方支付60%合同金额的项目首款,启动项目;

第2期:待全部测序分析服务供应完毕且最终验收合格后,采购方支付40%的尾款。120300020300090天总价:人民币(大写民)贰拾万叁仟元整(¥203000.00)成交供应商:北京诺禾致源科技股份有限公司 卢烨18001201576福建盛鑫招标代理有限公司

2021-1-4



九、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。

1.采购人信息

名 称:福建农林大学     

地址:福建农林大学        

联系方式:何老师13509357247      

2.采购代理机构信息

名 称:福建盛鑫招标代理有限公司            

地 址:福建盛鑫招标代理有限公司            

联系方式:小潘0591-87600110            

3.项目联系方式

项目联系人:小潘

电 话:  0591-87600110